Reclasificación de Clostridium difficile como Clostridioides difficile (Hall y O’Toole 1935) Prévot 1938

La reciente propuesta de Lawson y Rainey (2015) de restringir el género Clostridium a Clostridium butyricum y especies relacionadas tiene ramificaciones para los miembros de los géneros que quedan fuera de este clado y que no deben considerarse Clostridium sensu stricto. Uno de estos organismos de profunda importancia médica es Clostridioides difficile, que es una causa importante de diarrea intrahospitalaria y mortalidad en individuos. Con base en el análisis de la secuencia del gen 16S rRNA, el pariente más cercano de Clostridium difficile es Clostridium mangenotii con un valor de similitud del 94.7% y ambos se ubican dentro de la familia Peptostreptococcaceae, que está filogenéticamente muy alejada de C. butyricum y otros miembros de Clostridium sensu stricto. Clostridium difficile y Clostridium mangenotii producen abundante gas H₂ al cultivarse en caldo PYG y también producen una gama de ácidos grasos saturados e insaturados de cadena lineal y ramificada, con C16:0 como producto principal. El peptidoglicano de la pared celular contiene meso-DAP como diaminoácido diagnóstico. Con base en análisis fenotípicos, quimiotaxonómicos y filogenéticos, se propone el nuevo género Clostridioides gen. nov. para Clostridium difficile como Clostridioides difficile gen. nov. comb. nov. y que Clostridioides mangenotii se transfiera a este género como Clostridioides mangenotii comb. nov. La especie tipo de Clostridioides es Clostridioides difficile.